De werkzaamheden van Wegloophuis Utrecht worden structureel gesubsidieerd door de Dienst Maatschappelijke Ontwikkeling van de gemeente Utrecht. Daarnaast heeft het Wegloophuis de afgelopen jaren financiële bijdragen ontvangen van:

• Fentener van Vlissingen Fonds
• Fundatie van den Santheuvel, Sobbe
• Haëlla Stichting
• K.F. Hein fonds
• M.A.O.C. Gravin van Bylandt Stichting
• Stichting Elise Mathilde Fonds
• Stichting het R.C. Maagdenhuis
• Stichting Hulp na Onderzoek
• Stichting Ondersteuning Kritische Anti-Psychiatrische Initiatieven (OKAPI)